5.3.1.1 HAVE-NEOPLASM_LOCATION_BODY-PART

El esquema general relaciona las categorías HAVE-NEOPLASM (HN) y BODY-PART a través de LOCATION (o su inversa LOCATION-OF) que se define en los siguientes términos:

Figura 5.1: La relación LOCATION

Bajo la relación LOCATION hemos englobado casos que podrían responder a una relación distinta como ORIGIN o AFFECTS. Así, ejemplos tales como 'epithelial cancer' y 'abdominal tumor' se podrían entender como 'cáncer originado en el tejido epithelial' [HN_ORIGIN_TISSUE] y 'tumor que afecta a la cavidad abdominal' [HN_AFFECTS_PHYSIOLOGICAL-SYSTEM], dos procesos que pueden ser muy distintos. Sin embargo, simplemente a partir del FT 'epithelial cancer' o 'abdominal tumor' no se puede deducir si subyace la relación ORIGIN o AFFECTS, aunque no cabe duda de la relación LOCATION. Por tanto la elección de una relación u otra estaría supeditada a un análisis contextual mucho más preciso.

Ejemplos de formalización del esquema HN_LOCATION_BODY-PART son los siguientes:

HAVE-NEOPLASM		location (event-state-relation: case-role)	BODY-PART
	TUMOR	3947      tumor site      27 2683      site of tumor 2 1161      location of the tumor      3	PLACE
			_PHYSIOLOGICAL -SYSTEM
	CANCER	88     adrenocortical cancer      6 192    anal cancer                83 446    biliary cancer             3 454    bladder cancer             144 1348      gynaecological cancer      4 2410      parathyroid cancer  29 1214      ethmoid sinus cancer       5 469    cancer in the testicle     2 517    cancer of the bladder      4 409    cancer of the parathyroid glands  3
	OSTEOSARCOMA	32     extremity osteosarcoma     3 45     osteosarcoma of the extremity     5 27     osteosarcoma located in the extremities 2
				_TISSUE
	TUMOR	1068      epithelial tumors      6 2162      neuroepithelial tumor      9 2590      papillary tumors    3   2779      tumors of glandular epithelium 3   2785      tumors of soft tissues      3
	CARCINOMA	508    follicular carcinoma       13 1236      squamous carcinoma  20 1466      urothelial carcinoma       12
	ADENOCARCINOMA	78     ciliated adenocarcinoma    2
				_CELL
	CANCER	3568      transitional cell cancer      28
	TUMOR	451    astrocytic tumors      5 416    blue cell tumors    2 647    clear cell tumors      5 1087   isolated tumors of myeloblasts    2
	CARCINOMA	609    hepatocellular carcinoma      91 1092      renal cell carcinoma       29 1133      signet ring carcinoma      3       985    squamous cell lung carcinoma      2
	LYMPHOMA	177      follicular large cell lymphoma      5

Tabla 5.6: HAVE-NEOPLASM_LOCATION_BODY-PART

Como encabezado de la tabla y en negrita se presenta el esquema frasémico, HAVE-NEOPLASM_LOCATION_BODY-PART. En el margen izquierdo, bajo el evento HN se sitúan los lexemas pertenecientes a la CL HAVE-NEOPLASM que han servido para extraer los ejemplos de FT; en el margen derecho, se encuentran tanto superordinados como subordinados de BODY-PART y, finalmente, en el centro se han incluido ejemplos de formalización léxica del esquema frasémico. Esta misma estructuración de la tabla será la que se siga en los sucesivos apartados.

En primer lugar, en la tabla 5.6 se pueden observar formalizaciones tales como 'tumor site', 'site of tumor', 'location of the tumor' que responden a PLACE, concepto con el que BODY-PART mantiene tres niveles de diferencia en la ontología.

El esquema general se ha subdivido en tres niveles jerárquicamente ordenados: PHYSIOLOGICAL-SYSTEM, TISSUE y CELL, una subdivisión que responde al análisis de los ejemplos de nuestro corpus y refleja dos dimensiones a partir de las cuales los expertos del ámbito oncológico suelen clasificar los tumores: i) desde un punto de vista anatómico; ii) desde un punto de vista histológico, es decir, según el tipo de tejido (agrupación de células, fibras y productos celulares varios que forman un conjunto estructural).

Así, al esquema HN_LOCATION_PHYSIOLOGICAL-SYSTEM responderían todos los FT que hacen referencia a un proceso neoplásico localizado en una parte del cuerpo a excepción del tejido y las células, inferiores jerárquicamente. Como se puede observar en los ejemplos de la tabla, se puede tratar de una glándula ('parathyroid cancer'), un sistema fisiológico ('gynaecological cancer'), una extremidad ('extremity osteosarcoma'), etc. Por tanto, su representación en el módulo ontológico se hará en función de la siguiente estructuración:

Figura 5.2: Estructuración de BODY-PART en la ontología

En lo que se refiere a la estructura sintáctica a través de la que se formaliza este esquema frasémico, hemos encontrado las siguientes:

(104)
a. PHYSIOLOGICAL-SYSTEM HAVE-NEOPLASM 'adrenocortical cancer', 'parathyroid cancer'
b. HAVE-NEOPLASM in PHYSIOLOGICAL-SYSTEM 'cancer in the testicle'
c. HAVE-NEOPLASM of PHYSIOLOGICAL-SYSTEM 'cancer of the bladder'
d. HAVE-NEOPLASM LOCATION BODY-PART 'osteosarcoma located in the extremities'

A la izquierda de la flecha, hemos situado los conceptos que aparecen explícitamente, de una u otra forma, en los FT situados a la derecha de la flecha. Así, en (104a) observamos que, en primer lugar, aparece el concepto PHYSIOLOGICAL-SYSTEM seguido de HAVE-NEOPLASM, una estructura a la que responden los FT 'adrenocortical cancer' y 'parathyroid cancer' que no cuentan con ningún tipo de formalización léxica de la relación subyacente LOCATION. En los FT de (104b) y (104c), se observa que los conceptos HAVE-NEOPLASM y PHYSIOLOGICAL-SYSTEM se unen a través de las preposiciones in/of, que en estos casos son las responsables de formalizar la relación LOCATION. Finalmente, en (104d) la relación LOCATION aparece como 'located in' en el FT correspondiente.

En cuanto al esquema HN_LOCATION_TISSUE, éste agruparía a todas aquellas unidades que ofrezcan información de tipo histológico, es decir, sobre la estructura microscópica del tejido que se divide en cuatro grandes grupos que han de estar representados en la ontología:

EPITHELIA (COVERING & LINING EPITHELIA, GLANDULAR)

CONNECTIVE-TISSUE (BLOOD, BONE, CARTILAGE, PROPER)

MUSCLE-TISSUE (SKELETAL, CARDIAC, SMOOTH)

NERVOUS-TISSUE

Como ejemplos de este esquema aparecen 'epithelial tumors', 'tumors of glandular epithelium' o 'tumors of soft tissues' pero también se puede observar en la tabla que para establecer los distintos tipos dentro de cada grupo se utilizan atributos tales como SHAPE-OF-TISSUE-CELLS (squamous, transitional, cuboidal, columnar) o CELL-SURFACE (ciliary, papillary, follicular, etc.), por lo que se podría establecer un esquema frasémico correspondiente a HN_LOCATION_CELL que cuenta con realizaciones como 'transitional cell cancer' o 'follicular large cell lymphoma'.

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